Portada

DETEÇAO DE ORTóLOGOS E PARáLOGOS UTILIZANDO A áRVORE FILOGEN IBD

EDIÇOES NOSSO CONHECIMENTO
12 / 2024
9786208405762
Portugués

Sinopsis

A ortologia e a paralogia sao conceitos centrais na biologia evolutiva. A previsao de ortólogos (genes homólogos que divergiram devido à especiaçao) e paralólogos (genes homólogos que divergiram devido à duplicaçao) é parte integrante de muitos métodos de genómica comparativa. Existem vários métodos utilizados para inferir ortologia e paralogia. A ortologia e a paralogia podem ser inferidas utilizando métodos baseados em grafos e métodos filogenéticos. No entanto, o método baseado em análises filogenéticas assemelha-se muito à definiçao original de ortologia e paralogia e é conhecido por ser exato. No presente trabalho, é desenvolvido um pipeline para a deteçao de ortólogos e paralólogos com base na abordagem filogenética. Um conjunto de proteínas foi descarregado do UniProt e foi criada uma base de dados. Foram detectados ortólogos e parálogos para a sequência de proteínas em causa. Foram utilizados o algoritmo de sobreposiçao de espécies e o limiar de distância patrística entre pares para identificar a previsao exacta e ajustada de parálogos e ortólogos. Foi desenvolvida uma interface amigável para facilitar a utilizaçao.