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La pollution affecte la qualité de l?eau des lacs et autres ressources d?eau douce dans le monde entier. Elle peut prendre de nombreuses formes et provenir de sources industrielles, agricoles ou municipales , parmi les exemples les plus courants, on peut citer les pesticides, les herbicides, les eaux usées et les déchets. Les lacs présentent souvent des niveaux de pollution élevés par rapport aux paysages et à l?environnement qui les entourent. Les rivières et les ruisseaux drainent les polluants du paysage qui se concentrent dans les lacs et autres plans d?eau. Les espèces aquatiques telles que les poissons peuvent être extrêmement riches en contaminants, car certains polluants ne se dissolvent pas facilement et ne se diluent pas dans l?eau, mais sont absorbés par les organismes. Certaines espèces d?organismes aquatiques sont particulièrement sensibles à la pollution , elles sont utilisées comme indicateurs de la pollution et sont appelées bioindicateurs. Comme les lacs drainent un vaste paysage environnant, ils reflètent les processus et les actions qui se déroulent autour d?eux. Lorsque des produits chimiques sont déversés, ils peuvent s?écouler dans les cours d?eau voisins et être transportés en aval dans les lacs.
